骨折三年后還隱隱作疼通常不正常，可能與愈合不良、慢性炎癥或繼發骨關節炎等因素有關。建議及時就醫檢查明確原因。

骨折愈合后局部疼痛多由瘢痕組織增生或軟組織粘連導致，活動時牽拉神經末梢引發隱痛。部分患者因康復期活動過早或固定不牢固，出現延遲愈合甚至骨不連，表現為持續性鈍痛。骨質疏松患者骨折后骨痂形成緩慢，力學強度不足，輕微外力即可誘發疼痛。長期疼痛還需排除創傷性關節炎，關節面不平整導致軟骨磨損，表現為陰雨天或負重時疼痛加重。

少數情況下，疼痛可能與局部神經損傷、異位骨化或隱匿性感染相關。神經損傷后形成的神經瘤可產生放電樣疼痛，異位骨化會壓迫周圍組織引發不適。既往開放性骨折患者若清創不徹底，可能形成慢性骨髓炎，表現為紅腫熱痛反復發作。腫瘤或代謝性骨病導致的病理性骨折，疼痛往往持續存在且進行性加重。

建議進行X線、CT或MRI檢查評估骨愈合狀態，必要時檢測骨代謝指標。疼痛明顯時可短期使用洛索洛芬鈉片、塞來昔布膠囊等非甾體抗炎藥，配合超聲波或沖擊波物理治療。日常應避免患肢過度負重，加強鈣和維生素D攝入，適度進行游泳或騎自行車等低沖擊運動。若確診骨不連或嚴重關節炎，可能需要植骨手術或關節置換。